내가 왜 공부를 해야 하는가에 대한 목적의식이 생길때 학생은 비로소 학업에 대한 동기가 부여된다. 기독 교육기관은 학생 스스로가 자기주도적인 학습을 계획하고 실천해 나가도록 돕는 일을 한다. 공동체를 통하여 배운 지식을 실천하며 자신의 존재의식과 목적의식을 가지게 된다.

또한 기독교적 세계관을 가지고 과목에 대한 지식을 성경적 관점으로 보게 하도록 교사와 학생은 서로 상호협력하는 것이다. 공교육의 현실에서는 이러한 과정은 불가능하다. 교회학교의 교육에서도 역시 한계가 있다. 오로지 전일제인 기독 교육기관만이 가능한 것이다.